Curso:

Herramientas moleculares para la identificación y caracterización de hongos y levaduras

 

Fecha: 20 al 24 de junio de 2016

Horario: lunes a viernes de 9 a 13 hs. y de 14 a 18 hs.

Lugar: Salón Píriz Mc Coll (Instituto de Química)

DOCENTES RESPONSABLES: Dras. Silvana Vero y Gabriela Garmendia

DOCENTES PARTICIPANTES:

Docentes de la Cátedra de Microbiología. Facultad de Química. UdelaR.

Dra. Silvana Vero, Dra. Gabriela Garmendia, Dra. Silvana Alborés, MSc. Mariana Gonda, B.C. Adalgisa Martínez, Dra. Ana Acevedo, Lic.Ana Ingold

Docentes invitados de la Universidad Nacional de Río Cuarto. Argentina

Dra. Lilia R. Cavaglieri

Dra. Ana Dalcero

DESTINATARIOS: Egresados de Química, Agronomía, Lic. Bioquímica o Biología

OBJETIVO: Discutir y analizar la utilidad de las herramientas moleculares para la identificación y caracterización de hongos filamentosos y levaduras. A barcar los principios básicos sobre identificación y tipificación molecular de hongos, la descripción y utilidad de los métodos utilizados.


PROGRAMA:

Teórico:

Principios básicos sobre identificación molecular de hongos

Identificación a nivel de especie:

- Regiones génicas utilizadas para la identificación.

- Bases de datos

Análisis multigénico en la determinación de especies fúngicas. Fundamentos y ejemplos.

Pasos del análisis molecular:

-Extracción ADN de hongos filamentosos y levaduras

-Purificación de ADN. Amplificación de regiones de interés.

-Análisis de secuencias. Comparación con bases de datos.

Uso de RFLP en identificación. Fundamentos y aplicabilidad del método

Tipificación de hongos y levaduras a nivel de subespecie, quimiotipo o cepa. Métodos utilizados: RAPD, AFLP. Microsatélites, RFLP mitocondrial.

Cuantificación de hongos por Real Time PCR. Fundamentos y ejemplos.

Presentación y discusión de casos aplicados:

- Identificación molecular de levaduras antárticas

- Identificación molecular de hongos causantes de deterioro de productos panificados

- Diseño de PCR en tiempo real para cuantificar Fusarium poae en cebada.


Práctico:

El curso práctico consiste en la resolución de una situación problema,

la cual se entregará el primer día del curso. Se plantearán 5 situaciones problema que consistirán en identificar un hongo, dentro de un contexto que limitará las especies a las cuales pueda pertenecer. Los estudiantes deberán proponer los métodos moleculares adecuados para la resolución del problema, discutirlos y llevar a cabo en forma práctica el método más adecuado.

Cada subgrupo de 4 o 5 estudiantes será guiado por un docente.

Las situaciones problema serán:

1. Identificación a nivel de especie de un aislamiento de Pleurotus

2. Identificación a nivel de especie de un aislamiento de Fusarium patógeno de trigo

3. Identificación a nivel de especie de un aislamiento de levaduras

4. Verificación de la identidad de un aislamiento de Penicillium utilizado en la producción comercial de queso azul

5. Identificación a nivel de especie de un hongo de origen clínico

Día 1

Entrega de problemas. Planteo del problema por el docente encargado.

Extracción y purificación de ADN genómico de la muestra. Amplificación de la región génica a estudiar

Día 2

Análisis informático de regiones génicas para la identificación del hongo. Alineamiento y análisis de secuencias. Bases de datos. Uso de programas para análisis de restricción

Visualización de ADN extraído el día anterior y amplificación de la región génica de interés.

Día 3

Visualización de producto de amplificación obtenido el día anterior.

Preparación del RFLP de la región amplificada para la identificación del hongo o levadura problema.

Día 4

Análisis de la secuencia de la región amplificada

Análisis del resultado del RFLP obtenido.

Discusión sobre los resultados obtenidos frente al problema planteado. Preparación de la presentación de resultados.

Día 5

Presentación y discusión de las situaciones problemas planteadas en el curso práctico.

 

EVALUACIÓN

Prueba individual escrita

Presentación grupal del planteamiento y resolución de la situación problema desarrollada durante el práctico

Los alumnos de posgrado deberán plantear un proyecto en base a objetivos relacionados con la temática del curso.

 

Costo: $ 3200

Se deben abonar en la Sección Tesorería de Facultad de Química (Isidoro de María 1614 planta baja, de lunes a viernes de 10 a 13 hrs), o realizando depósito en el BROU (cuenta corriente nº 1840015257), el talón se debe enviar por correo electrónico a ep@fq.edu.uy.

Confirmación previa requerida, enviando la ficha de inscripción cuyo link se encuentra debajo.

Descarga de ficha: http://www.fq.edu.uy/es/FormulariosEP/Inscripcion%20cursos